对于任何一种特定的靶抗原,都有不止一种有效抗体。为了缩小选择范围,实验中通常要考虑以下几个方面:
1. 分析或者应用类型
2. 样品的性质
3. 样品的种类
4. 抗体宿主的种类
5. 抗体的标记和检测
Abcam 网站有一个搜索功能。在搜索框中输入蛋白或其它靶物质的名称,就会出现一个列表,可以通过产品类型、目的、实际用途、特 异反应性、宿主种类、克隆性和结合情况进行筛选。
用途
抗体数据表所显示的用途都是已经得到检测证明可以发挥作用的。如果某项用途没有列出,并不意味着抗体不合适,而是还没有检测是 否有该项用途或不知道抗体如何发挥作用。如果已经检测并证明无效也会在表中列出。
样品的性质
样品的性质会告诉您哪个抗体最合适,至少要考虑以下两个方面:
1. 要检测的蛋白区域。刺激宿主动物产生抗体的具有免疫原性的物质种类繁多,包括全长的蛋白、蛋白片段、多肽、整个生物机体(例 如细菌)或细胞。免疫原通常在数据表中会有显示(尽管在很多例子中由于专利原因找不到关于免疫原的详细描述) 。如果要检测的是 一个蛋白片段或全长蛋白的异构体或特定区域,那就要求选择的抗体是由该特异片段或区域或者包含该特异片段或区域的免疫原刺激产 生的。如果要通过 FACS 去检测活细胞表面蛋白,则要求选择的抗体是由蛋白的细胞外区域刺激产生的。
2. 样品的处理工艺。有些抗体要求样品先进行特殊处理。例如,许多抗体只识别降解或变性蛋白,可能因为这样会暴露藏在二次或三次 折叠后蛋白内部的抗原表位。另一方面,有些抗体仅识别自然折叠状态蛋白上的表位。(Abcam 公司用于 western blotting 的抗体, 样品都需进行降解和变性处理,除非在数据表中特殊标明)。当搜寻用于免疫组化的抗体时,则应注意有些抗体只适合用于未固定冷冻 组织。有时,抗原修复步骤则必不可少,这样可以消除由福尔马林固定所引起交联,因为有些抗体不能结合福尔马林固定和石蜡包埋组 织中的靶目标。在数据表的应用章节会明确指出上述限制。
样品种类
尽管由于具有足够多的同源氨基酸序列,抗体可以和其它物种的同一靶蛋白反应,但是我们选择的抗体仍然应该是来源于同一物种的抗 原刺激产生的。如果样品不是来自于列表所示的物种之一,也不能说明该抗体不可以用来检测这种样品,而可能是来自该物种的样品没 被检测过,因此我们很难推荐它的适用性。根据序列相似性可以预测交叉反应性:值得骄傲的是 Abcam 在数据列表里有 ExPASy 和 NCBI BLAST 的链接,可以比对不同物种来源氨基酸序列的同源性。
选择一抗宿主的类别
一般来说,当用标记二抗来检测非标记一抗时,产生一抗的宿主动物的类别就非常重要。对于免疫组化,产生一抗的宿主应尽可能的和样 品的宿主种类不同,以避免二抗的免疫球蛋白与样品中内在的免疫球蛋白发生潜在的交叉反应。例如,用于检测鼠源蛋白的一抗就不应 来源于鼠或大鼠,来源于兔则是比较适合的选择,接下来用检测分子(酶、荧光、生物素等)标记的抗兔 IgG 的二抗进行结合。如果有 已标记的一抗则可以直接避免上述交叉反应发生。对于不含内源性免疫球蛋白样品的检测,宿主的种类选择不用很严格。例如进行 western blotting 的细胞裂解液就被认为不包含 IgG。而组织溶解液和组织培养上清(包括血清)则被认为是含免疫球蛋白的。Western blotting 时 IgG 会以 50 和 25kDa 的条带出现在降解和变性样品中,分别相当于 IgG 分子的重链和轻链。
选择二抗
二抗应来源于抗一抗的物种。举例来说,如果您的一抗来源于鼠,那么二抗就应该选择抗鼠的。我们建议仔细核对二抗数据表以确定您要 使用的二抗。
Abcam 提供有大量标记各种荧光物质和染色物质的二抗。
检查您所用的一抗数据表的底部,将会显示一些合适的二抗。
为了找到您自己的二抗,可以使用我们的导航框或通过主页中心的链接来选择产品类型,然后选择您一抗的种类,这样会显示大量适用于 一抗种类的二抗。
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双重染色抗体的选择
对细胞培养液或组织上清液进行双免疫染色要求非标记一抗来源于不同物种的动物,而二抗则特异性识别其中一种一抗。二抗如果与其他 动物来源的免疫球蛋白有交叉吸附,则会在数据表中明确说明。
荧光和染料标签
标签结合在抗体上使抗体的结合可见。标签的选择依据以下几个方面
1. 检测方法:荧光或有色沉淀。荧光标签会在特定波长的光激发下发光。根据它们自己激发和发光性质不同,有一些荧光标签是可用的。 在结合了合适的底物时,酶标签 HRP 和AP 可以形成有色沉淀。
2. 有效的封固剂(只限免疫组化):AEC、Fast Red、INT 或是其它的水溶性染色剂均溶于酒精,因此要求使用水溶性封固剂。以上提到 的其他有机物要想得到较好的折射率,最好使用有机封固剂封固。
荧光素标签需要水溶性封固剂。胆藻素蛋白(藻青蛋白 / 藻红蛋白)需要不加甘油的水溶性封固剂,否则会产生淬灭效应。
3. 生物素标记的抗体对于信号的放大是很有效的,比如可应用于亲和素 - 生物素 - 酶或荧光复合物(通常缩写为ABC 试剂)或者亲和素 或链霉亲和素结合酶或荧光染料检测法。
未纯化抗体的建议稀释和浓缩
未纯化抗体在某一特定抗体浓度下会发生很显著的变化。如果不清楚给定的未纯化抗体样品的浓度,就可以参考下面的“特殊范围” 作为估计的指导。